Американские исследователи смогли полностью расшифровать геном пациента за пять часов и две минуты, это новый рекорд, сообщает официальный блог NVIDIA.
Ранее подобные операции требовали нескольких суток. Ученые отмечают, что современные технологии вплотную приблизились к возможности расшифровывать генетическую информацию практически в режиме реального времени.
Эксперимент проводили при секвенировании ДНК 12 пациентов. Рекорд установили исследователи из Стэнфордского университета при участии NVIDIA, Oxford Nanopore Technologies, Google, Медицинского колледжа Бейлора и Калифорнийского университета в Санта-Круз.
Ускорить процесс удалось благодаря оптимизации рабочих этапов секвенирования. В частности, поиск оснований и вариантов ускорили с помощью графических процессоров NVIDIA в Google Cloud.
Итоговая скорость составила порядка 100 миллиардов нуклеотидов в час. При этом ученые не собираются останавливаться на достигнутом — они намерены ускорить расшифровку генома еще в несколько раз.